Próximos Passos - Transcrição do Vídeo

Notas importantes

Esta página mostra apenas a transcrição. Para instruções completas passo a passo, retorne ao material do curso.

Boas-vindas

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Parabéns, você conseguiu!

Você chegou ao final e completou o curso de treinamento Hello Nextflow. Realmente esperamos que você tenha aproveitado. Obrigado por ter ficado conosco até o final, e realmente apreciamos o tempo e o esforço que você dedicou para aprender Nextflow. Realmente esperamos que seja útil para o seu trabalho.

Outros cursos em training.nextflow.io

Não se esqueça de continuar voltando ao training.nextflow.io. Estamos adicionando novos cursos curtos o tempo todo e também atualizamos muito do material que já está aqui. Então este curso de treinamento Hello Nextflow será atualizado ao longo do tempo.

Isso é particularmente importante porque estamos atualizando a sintaxe no Nextflow, e 2026 trará muitas novas funcionalidades, então este curso terá uma aparência e sensação um pouco diferente na próxima vez que o fizermos em 2027.

Especificamente, quero destacar a página "Nextflow for Science". Esses são cursos curtos e são projetados para dar continuidade a este curso Hello Nextflow. E eles mostram como usar Nextflow com casos de uso específicos diferentes, seja genômica ou RNAseq, ou todos os tipos de coisas diferentes. Estamos tentando adicionar mais casos de uso científicos o tempo todo.

Também há os Side Quests. Quando desenvolvemos um curso como Hello Nextflow, há tanto que poderíamos cobrir, e é difícil manter tudo dentro do escopo. Então, se há um tópico particular que achamos interessante para as pessoas, que merece uma cobertura mais profunda, colocamos isso em um Side Quest.

Vá dar uma olhada e se houver coisas diferentes que podem ser relevantes para o seu trabalho, como nf-test ou fazer coisas diferentes com metadados, e padrões comuns de script, confira os Side Quests e veja se isso pode ser útil para aprender mais.

Há também o curso sobre nf-core. Esperamos que você esteja familiarizado com o projeto neste ponto, mas se não estiver, vá conferir. Há quase 150 pipelines diferentes lá para diferentes tipos de análise e diferentes tipos de dados, então é totalmente possível que haja um pipeline pronto para uso para o tipo de análise de dados que você precisa.

Importante também, há componentes no nf-core, quase 1700 módulos diferentes, diferentes processos e wrappers para ferramentas. E com as ferramentas que vêm com o nf-core, você pode misturar e combinar esses componentes e construir seu próprio pipeline como blocos de Lego. Muito mais rápido e mais reprodutível.

Seqera Platform

À medida que você amplia seu uso do Nextflow, confira o Seqera Platform, é a melhor maneira de executar Nextflow. Você pode executar na sua própria infraestrutura, então HPC ou AWS, Azure, Google Cloud, Oracle e mais. Você também pode usar nosso próprio Seqera Compute se não quiser gerenciar nenhuma infraestrutura de computação.

O Seqera Platform realmente simplifica a configuração dessas infraestruturas de nuvem complexas com recursos como Batch Forge, que cria o ambiente para você. E também realmente ajuda com observabilidade e registro de auditoria e conformidade.

Objetivamente, ele faz os pipelines executarem mais baratos e mais rápidos com tecnologias como Fusion, que otimizam o acesso ao disco e as transferências de dados. E há também otimização de pipeline para garantir que a configuração dos seus pipelines esteja o mais ajustada possível.

Há recursos totalmente diferentes além de executar pipelines também. Temos Studios onde você pode executar análises interativas e criar ambientes a partir de qualquer imagem docker personalizada que você criar. E o Data Explorer, que ajuda você a explorar seus diferentes sistemas de arquivos onde quer que eles estejam.

Há uma camada gratuita para o Seqera Platform, então você pode usar praticamente todos esses recursos gratuitamente agora. E daremos a você cem dólares de crédito de computação gratuito com o Seqera Compute se você se inscrever com seu endereço de e-mail organizacional. Finalmente, há um programa acadêmico, então se você está trabalhando em uma universidade, confira a página de preços, encontre o formulário lá e nos avise, e faremos o upgrade para o Cloud Pro gratuitamente.

Ajuda da comunidade e eventos

Ok. Seguindo em frente. Se você precisar de algum suporte com Nextflow, confira community.seqera.io. É muito ativo e esperamos vê-lo lá e discutir seus diferentes problemas e casos de uso, e talvez agora você possa até ajudar outras pessoas.

Também temos muitos eventos acontecendo. Temos eventos da comunidade vindos do nf-core e Nextflow. Temos um hackathon nf-core online e distribuído em março, tivemos mais de mil pessoas participando no ano passado com locais em todo o mundo. Então, por favor, junte-se a nós para isso se puder.

E também temos eventos Nextflow Summit, um em Boston, e então temos um evento em Barcelona e online. Palestras fantásticas onde você pode ouvir sobre pessoas usando Nextflow de maneiras realmente massivas e incríveis e empolgantes diferentes. E também há hackathons associados a esses eventos e treinamento presencial.

Podcast e blog do Nextflow

Se você quiser se manter atualizado com as coisas acontecendo no ecossistema Nextflow, confira o seqera.io/blog.

Há uma seção para Nextflow lá onde você pode ouvir posts de blog da comunidade de pessoas trabalhando na comunidade, e também posts de blog da Seqera sobre atualizações para Nextflow e as outras ferramentas que geramos.

Eu também gostaria de fazer um anúncio para o meu projeto favorito, que é o Nextflow Podcast. Confira no Spotify, ou Apple Music, ou YouTube. Lançamos novos episódios periodicamente onde converso com outras pessoas, seja trabalhando com Nextflow ou tecnologias associadas, ou pessoas na comunidade. E fazemos mergulhos técnicos reais e profundos sobre como as coisas funcionam e o que as pessoas estão fazendo. Então, se você estiver interessado, confira. Eles são muito divertidos.

Agradecimentos

Ok, eu gostaria de fazer uma série de agradecimentos. A equipe de treinamento da Seqera é responsável por este material. Estou sentado na frente de uma câmera, mas realmente todo o trabalho duro foi feito por essas outras pessoas. Destaque especial para Geraldine, que escreveu e atualizou este material de curso de treinamento para Hello Nextflow e outros. E também Jon, que realmente ajudou, especialmente com a atualização da sintaxe para a nova sintaxe do Nextflow e também escrevendo muitos dos cursos ele mesmo. Outros na equipe de desenvolvimento científico como Rike, Rob, Florian, e muitos outros tiveram uma contribuição enorme no material com o qual estivemos trabalhando.

Eu também gostaria de agradecer às pessoas na comunidade. As novas traduções, por exemplo, que são muito novas, foram fortemente influenciadas por pessoas no programa de embaixadores e em outros lugares. E realmente, a natureza de código aberto do material de treinamento significa que temos pull requests e issues chegando com bastante frequência, o que realmente nos ajuda.

Pesquisa

Agora que você terminou, se ainda não o fez, por favor faça rapidamente a pesquisa de feedback. Está no site training.nextflow.io logo abaixo da seção Hello Nextflow.

São apenas cinco perguntas. É realmente muito rápido, mas isso nos permite rastrear aproximadamente quantas pessoas estão fazendo o treinamento e também você pode nos dizer como melhorar o material de treinamento. Nós realmente verificamos todas as respostas, então realmente valorizamos sua contribuição aí.

Despedida

Mais uma vez, muito, muito obrigado por se juntar a nós neste curso, e nesta jornada. Abra uma issue ou Pull Request no GitHub se você notou algo no material de treinamento que você acha que poderia ser melhorado. E realmente espero vê-lo em outro curso de treinamento Nextflow, ou talvez em um hackathon ou evento. Obrigado novamente.​